Recordad que Squall les dice a todos que tienen que pensar fuertemente en el lugar al que quieren ir.
Yo creo que simplemente estaban pensando el uno en el otro y por eso se reunieron. Y aparece el campo de la casa de edea porque Rinoa en el momento en el que encuentra a Squall piensa en que le habria gustado cumplir la promesa de reunirse ahí, o algo parecido.
Y Squall aparece en principio en el desierto porque tiene una piedra enorme en la cabeza. Aunque supongo que quitando eso es la sensación de eterna soledad al pensar que se ha perdido en el espacio-tiempo